<befehl> 2>&1 | tee <logfile>
Das ganze funktioniert so: Die Fehlerausgabe wird mit dem Zusatz 2>&1 auf die Standardausgabe umgeleitet. Diese wiederum wird mit einer Pipe dem Programm tee übergeben, das den Text ausgibt und gleichzeitig in eine Datei schreibt.
Beispiel:
$ ./configure 2>&1 | tee configure_log.txt